數字檔案館建設是一個高技術含量的檔案館建設，需要一系列基礎工作的支持，而我們國家在信息技術基礎方面比較薄弱，又加之我國數字檔案館建設起步較晚，因此，數字檔案館的建設在實踐中面臨諸多艱巨問題，包括以下幾方面：
（一）從思想觀念上看，傳統人文意識與檔案信息網絡化存在矛盾
中國傳統的檔案工作具有 “縱向隸屬”、“封閉隔絕”特點，而數字檔案館是基于檔案信息網絡的檔案館，必須崇尚網絡精神，具備開放意識，注重科學系統性，加強縱橫聯系。所以此時傳統人文意識與開放的檔案信息網絡化就形成尖銳的矛盾。目前，傳統意識在我們的數字檔案館建設工作中仍可以彰顯出弊端，具體表現為：缺乏系統的思維觀念橫向聯系少，協調能力弱，檔案信息資源共享網絡建設阻礙重重，檔案信息數據庫建得不少但高質量的寥寥無幾等等。種種跡象表明，如果沒有思想觀念上的大轉變，數字檔案館建設很難取得成功。
（二）從投入資金上看，政府資金的支持力度與數字檔案館的建設投入脫節
數字檔案館的建設是一個高投入的系統項目，沒有政府的支持很難獲得成功。由于我國正處于經濟建設、改革發展期，各行各業都需要國家的財力支援，國家雖然對數字檔案館的建設提供了一些財力支持，但這與數字檔案館的建設所需相差甚遠。目前連基本的檔案事業費都難以保證的檔案館還為數不少。在這種資金匱乏的狀況下，數字檔案館的大規模系統性建設計劃只能放長遠一些，數字檔案館建設的成功還需要一個相當長的歷史過程。
（三）,從數據庫建設上看，檔案信息數據庫建設水準與數字檔案館的要求差距懸殊
這主要有以下幾方面表現：絕對數量多，優質數量少，資源浪費嚴重；規范化和標準化程度低，標引與檢索點選取沒有嚴格的質量控制，各自為政；數據庫類型比較單一，檔案信息目錄數據庫居多，其他全文型、多媒體檔案信息數據庫偏少，難以滿足用戶實際需求；印刷型檔案數量龐大，數字化轉換工作不容樂觀等等。
（四）從網絡基礎上看，網絡通信速度無法滿足數字檔案館的廣泛使用
數字檔案館是借助于網絡開展服務的，在這里，網絡通信速度就成了數字檔案館利用效率的關鍵。目前，在我國大部分地區，網絡通道不暢，主干道帶寬不足，上網速度較慢；此外，對我國用戶來說還背負著一個昂貴的上網費問題。一般的家庭上網，中小城市每月網費大概七八十左右，像北京等大城市的網費則高達每月120元以上。
（五）從研究開發上看，網絡檔案信息保存技術的研究進展緩慢
數字檔案信息的長期安全保存涉及到格式、媒體的轉換以及隨技術更新對保存的檔案信息進行了遷移等問題，具有很高的技術性。只有在數字技術高度發展的前提下，這個難題才能攻破。目前我國對數字檔案信息長期保存的研究較少。數字技術的高度發展還尚待時日，這勢必會影響數字檔案館建設的進程。
總之，由于國情和條件的限制，數字檔案館在我國的發展任重而道遠。因此，檔案館在明確數字檔案館為檔案館發展方向的同時，還仍然需要扎扎實實地處理實體檔案館的一切業務，而且業務工作特別是檔案信息數據庫建設心更標準化和規范化，并在檔案信息資源建設中堅持電子型、數字型和印刷型并舉，為數字檔案館的成功構建打下堅實的基礎。
